Grippe, insolation, fracture au ski… tomber malade pendant ses congés n’est pas qu’un contretemps : c’est aussi un télescopage des arrêts maladie et des congés payés. La loi reconnaît désormais ce préjudice et offre aux salariés la possibilité de récupérer leurs jours de repos.
Congés payés et arrêts maladie ne s’opposent plus

Depuis le 24 avril 2024, le droit du travail français a intégré une réforme majeure en matière d’arrêts maladie survenus pendant les congés payés. Ce changement vise à harmoniser le droit national avec les exigences européennes, tout en répondant à une réalité sanitaire : la maladie ne s’arrête pas aux portes des vacances. Pour les soignants, les patients comme les employeurs, les implications sont nombreuses.
Quand la santé vient perturber le repos
L’Organisation mondiale de la santé (OMS) rappelle l’importance des périodes de repos dans l’équilibre psychophysique des travailleurs. Pourtant, chaque année, des milliers de Français voient leurs congés contrariés par des pathologies aiguës (gastro-entérite, Covid-19, virus grippal) ou des accidents de la vie (entorses, traumatismes, chutes, allergies, etc.).
Dans ces cas, le salarié était jusqu’alors doublement pénalisé : privé de santé, puis privé de repos. Grâce à l’application d’une directive européenne ancienne, la loi française permet désormais de reporter les congés non consommés en raison d’arrêts maladie, sous conditions.
Une reconnaissance juridique du droit au repos effectif
La réforme votée en avril 2024 introduit deux avancées majeures :
L’acquisition de congés pendant les arrêts maladie.
La possibilité de reporter les congés interrompus par les arrêts maladie survenus pendant les vacances.
Un salarié atteint d’une angine sévère ou hospitalisé pendant ses congés pourra, sur présentation d’un arrêt de travail valable, demander à récupérer les jours concernés, comme l’indique le site Service-public.fr. Cette mesure s’applique avec effet rétroactif pour les congés encore valables au 24 avril 2024.
Ce que cela change pour les professionnels de santé
Pour les médecins généralistes, urgentistes, pharmaciens ou spécialistes de médecine du travail, cette réforme implique :
Une vigilance accrue sur les certificats d’arrêts maladie délivrés en période de congés, qui peuvent désormais avoir un impact sur le solde de congés payés.
Une meilleure sensibilisation des patients à leurs droits en la matière, notamment pour les inciter à déclarer leurs arrêts maladie, même s’ils surviennent à l’étranger ou en déplacement.
Une articulation renforcée avec les employeurs dans le cadre de la médecine de prévention, pour éviter les malentendus lors de la reprise.
Ce nouveau droit est aussi un levier d’accès à la santé psychologique : pouvoir « récupérer » des congés gâchés réduit le sentiment d’injustice souvent exprimé par les patients fragilisés.
Une responsabilité élargie pour les employeurs
Si cette avancée est saluée par les syndicats et les praticiens, elle fait peser une nouvelle responsabilité sur les entreprises, y compris les plus petites. Elles doivent :
Tenir compte des jours de congés reportés,
Informer les salariés dans le mois suivant la reprise,
Adapter leur gestion RH pour éviter les erreurs de paie ou les conflits liés à la récupération.
Pour les structures de soins elles-mêmes — hôpitaux, cliniques, centres de santé — cette réforme complique la gestion des plannings en période estivale, avec des retours de congés plus étalés et des absences prolongées.
Une vigilance nécessaire face aux dérives et abus sur les arrêts maladie
Si cette avancée protège les droits fondamentaux des salariés, elle n’est pas sans susciter des inquiétudes du côté des employeurs, en particulier dans les secteurs à forte saisonnalité ou à effectifs restreints. Certains chefs d’entreprise redoutent une augmentation des arrêts maladie de courte durée au cours des congés, perçus comme des moyens détournés de prolonger les vacances ou d’éviter un retour prévu.
En l’absence de contrôle systématique par la caisse primaire d’assurance maladie (CPAM) ou d’une visite de reprise immédiate, la marge d’appréciation reste limitée. Ces craintes nourrissent une demande de renforcement des contrôles médicaux, notamment pour les arrêts prescrits à distance ou depuis l’étranger. Le défi sera de maintenir un équilibre entre protection légitime des salariés et prévention des abus, sans mettre en péril la confiance entre employeurs et collaborateurs.
Avec cette réforme des arrêts maladie pendant les congés payés, la santé du salarié devient un élément reconnu et protégé du droit au repos. Ce n’est plus seulement un enjeu administratif, mais une composante à part entière de l’équilibre entre travail, prévention et récupération. Un progrès, à condition qu’il s’accompagne d’une information claire et d’un dialogue renforcé entre tous les acteurs du soin et de l’emploi.
